MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017230	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017230	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017230	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017230	AGG	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017230	T	6	6	15158	15163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017230	TA	3	6	15184	15189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017230	TA	3	6	15193	15198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017230	GTT	2	6	16463	16468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017230	CTAA	2	8	16509	16516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017230	ATA	2	6	16525	16530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017230	AAC	2	6	17289	17294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017230	T	6	6	17336	17341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017230	A	7	7	17368	17374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017230	AT	3	6	18903	18908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017230	T	6	6	18931	18936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017230	A	7	7	18951	18957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017230	TTACA	2	10	19004	19013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017230	T	6	6	19014	19019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017230	AGGT	2	8	19036	19043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017230	ATTT	2	8	19106	19113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017230	TAAT	2	8	19138	19145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017230	TAA	2	6	19151	19156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017230	T	6	6	19170	19175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017230	TAA	2	6	19214	19219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017230	TTA	3	9	19220	19228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017230	A	6	6	21686	21691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017230	AGG	2	6	21695	21700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017230	A	6	6	22771	22776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017230	TAT	2	6	22799	22804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017230	TGA	2	6	22815	22820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017230	A	6	6	22829	22834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017230	ATTTT	2	10	22839	22848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017230	T	7	7	22908	22914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017230	A	7	7	22917	22923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017230	T	6	6	22984	22989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017230	TTA	2	6	23016	23021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017230	T	8	8	23054	23061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017230	T	6	6	23069	23074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017230	ATA	2	6	23107	23112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017230	ATA	2	6	23121	23126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017230	AT	3	6	23142	23147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017230	TGG	2	6	23166	23171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017230	T	7	7	23214	23220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017230	A	6	6	23246	23251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017230	TA	4	8	23266	23273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017230	AT	3	6	23277	23282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017230	A	8	8	23286	23293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017230	TAT	2	6	23299	23304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017230	TA	3	6	23344	23349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017230	T	8	8	23368	23375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017230	A	6	6	23390	23395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017230	TA	3	6	23417	23422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017230	A	6	6	24792	24797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017230	A	7	7	24800	24806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017230	CTC	2	6	26042	26047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017230	AAGTAA	2	12	26073	26084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017230	AT	3	6	26090	26095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017230	CAAAAA	2	12	26119	26130	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017230	AAGA	2	8	26227	26234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017230	AT	3	6	26251	26256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017230	AATTT	2	10	26271	26280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017230	GA	3	6	26326	26331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017230	TA	3	6	26423	26428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017230	TTA	2	6	27573	27578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017230	ATAA	2	8	27921	27928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017230	ATTTAA	2	12	27944	27955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017230	AAG	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017230	TTA	2	6	28054	28059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.